Ten problem może się pojawić w przypadku kiedy uszkodzeniu uległa wewnętrzna baza aplikacji, która przechowuje informacje o odebranych wiadomościach z serwera.
Możliwe jest wymuszenie ponownego odebrania wszystkich wiadomości po usunięciu lokalnego pliku 'popstate.dat'. Plik przechowuje informację o odebranych wiadomościach (plik przechowuje stan wiadomości pobranych przez Thunderbirda i pozostawionych na serwerze POP) Skutkiem usunięcia będzie ponowne wczytanie wszystkich wiadomości dostępnych w folderze INBOX.
Spowoduje to pojawienie się duplikatów wiadomości.
Duplikaty można usunąć automatycznie korzystając z dodatkowego narzędzia dostępnego w aplikacji Thunderbird (czytaj więcej).